Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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