Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
RxrbP28704 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms