Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms