Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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