Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms