Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms