Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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