Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3238W4VSP7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms