Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3550W4VSN7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms