Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt27Q9Z320 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms