Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac6Q9Z2V5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms