Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E4

Ppp1r17, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 17, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r17Q9Z2E4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r17Q9Z2E4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppp1r17Q9Z2E4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppp1r17Q9Z2E4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp1r17Q9Z2E4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms