Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms