Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd3Q9Z2D8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms