Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Cldn6Q9Z262 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Cldn6Q9Z262 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Cldn6Q9Z262 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cldn6Q9Z262 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cldn6Q9Z262 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn6Q9Z262 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Cldn6Q9Z262 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cldn6Q9Z262 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn6Q9Z262 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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