Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cldn8Q9Z260 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms