Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccne2Q9Z238 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccne2Q9Z238 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms