Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfxankQ9Z205 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms