Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stk39Q9Z1W9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stk39Q9Z1W9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stk39Q9Z1W9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms