Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nek4Q9Z1J2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms