Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NfkbiaQ9Z1E3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NfkbiaQ9Z1E3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms