Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Shcbp1Q9Z179 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Shcbp1Q9Z179 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms