Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sema4fQ9Z123 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema4fQ9Z123 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms