Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmg20bQ9Z104 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms