Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S6

Cldn10, Claudin-10, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn10Q9Z0S6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cldn10Q9Z0S6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cldn10Q9Z0S6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cldn10Q9Z0S6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn10Q9Z0S6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn10Q9Z0S6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn10Q9Z0S6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn10Q9Z0S6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn10Q9Z0S6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn10Q9Z0S6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn10Q9Z0S6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cldn10Q9Z0S6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cldn10Q9Z0S6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn10Q9Z0S6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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