Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cldn15Q9Z0S5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cldn15Q9Z0S5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cldn15Q9Z0S5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cldn15Q9Z0S5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cldn15Q9Z0S5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn15Q9Z0S5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn15Q9Z0S5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cldn15Q9Z0S5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn15Q9Z0S5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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