Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn13Q9Z0S4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Cldn13Q9Z0S4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Cldn13Q9Z0S4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Cldn13Q9Z0S4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Cldn13Q9Z0S4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Cldn13Q9Z0S4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn13Q9Z0S4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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