Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn3Q9Z0G9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn3Q9Z0G9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms