Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp46a1Q9WVK8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms