Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms