Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Scnn1bQ9WU38 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scnn1bQ9WU38 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms