Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pfdn5Q9WU28 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pfdn5Q9WU28 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pfdn5Q9WU28 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pfdn5Q9WU28 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pfdn5Q9WU28 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pfdn5Q9WU28 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pfdn5Q9WU28 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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