Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkraQ9WTX2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkraQ9WTX2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms