Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR0

Mmp16, Matrix metalloproteinase-16, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp16Q9WTR0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mmp16Q9WTR0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mmp16Q9WTR0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mmp16Q9WTR0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mmp16Q9WTR0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mmp16Q9WTR0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mmp16Q9WTR0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mmp16Q9WTR0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Mmp16Q9WTR0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Mmp16Q9WTR0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Mmp16Q9WTR0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Mmp16Q9WTR0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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