Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam50bQ9WTJ8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms