Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PplQ9R269 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PplQ9R269 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PplQ9R269 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PplQ9R269 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PplQ9R269 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PplQ9R269 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PplQ9R269 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PplQ9R269 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PplQ9R269 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PplQ9R269 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PplQ9R269 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PplQ9R269 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PplQ9R269 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PplQ9R269 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms