Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms