Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubd1Q9R1K7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms