Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Chst4Q9R1I1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Chst4Q9R1I1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chst4Q9R1I1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms