Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms