Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms