Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf346Q9R0B7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms