Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp2Q9R061 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms