Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsjQ9R014 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsjQ9R014 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms