Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcf1Q9QZM3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms