Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms