Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VapbQ9QY76 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms