Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp1Q9QY53 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms