Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Opn4Q9QXZ9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms