Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr2e3Q9QXZ7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms